O programa oferece duas áreas de concentração: Patologia Humana e Patologia Experimental, nas seguintes linhas de pesquisa:
(I) Patologia e imunopatologia com ênfase nos mecanismos causadores das doenças infecciosas, parasitárias, crônico-degenerativas e genéticas;
(II) Abordagens diagnósticas e terapêuticas em doenças humanas e em modelos experimentais e
(III) Investigação de biomarcadores para doenças humanas e agentes anti-tumorais.